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    利用無細胞系統的定向演化技術優化核醣體 – RISE技術平台

    by Eric Juo 2024 年 1 月 19 日

    定向演化(Directed Evolution)是一個讓合成生物學家著迷的技術,這個概念在2018年榮獲諾貝爾獎,實驗內容是使用嗜菌體表達無數種枯草桿菌蛋白酶變體,再以有機溶劑篩選,挑出適者生存的變體,再次變異及表達,經過多輪的汰選後,產生能夠在有機溶劑中保持活性的枯草桿菌蛋白酶。如今這個技術也以不同的方式,成功在無細胞系統中執行。

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    利用酵素製造高價值產品的流程

    by Eric Juo 2024 年 1 月 12 日
    2024 年 1 月 12 日

    酵素具有區域和立體選擇性(Regio- and stereoselectivity),產物較少出現異構物,除此之外,不同於化學合成需要高溫或高壓的極端環境,酵素反應的條件更溫和,反應的溶液通常對環境比較友善,因此使用酵素製造高價值產品具有相當大的優勢。這篇文獻回顧詳細的將利用酵素製造高價值產品的流程進行拆解,依序介紹如何發現新酵素、如何生產重組酵素、如何改良酵素、如何用酵素生產產品以及可以用酵素生產甚麼。

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    優化無細胞蛋白質合成的3個步驟 | 100L級細胞萃取液和100ML級CFPS

    by Eric Juo 2023 年 12 月 31 日
    2023 年 12 月 31 日

    無細胞蛋白合成(Cell Free Protein Synthesis; CFPS)是非常吸引人的技術,能夠在短時間內生產所需要的蛋白,從細胞裂解液製備到進行CFPS反應生產實驗室規模1mg蛋白只需要不到一周的時間,而且細胞裂解液可以提前製備好,當需要生產蛋白時再組成CFPS反應,只需要一天就可以生產出需要的蛋白。不過要將提高產量到工業規模並且可以被廣泛應用,則需要注重批次生產的一致性,也就是針對生產過程的關鍵影響步驟進行品質管控。

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    綠能科技開發者都應該關注的新技術 | 自補充循環的酵素固碳系統

    by Eric Juo 2023 年 12 月 23 日
    2023 年 12 月 23 日

    生物固碳是目前地球上固碳量最大的方式,想要達到減碳目標不妨向生物取經。因此科學家想到了模仿代謝循環系統,挑選出一系列活性最佳的酵素,組成人工固碳循環系統,進行高效率的連續固碳。然而不直接使用自然界的固碳系統是有原因的,因為這些系統的關鍵酵素都含有難以克服的副作用,例如植物光合作用的RuBisCo酵素,除了固定二氧化碳以外,同時也會利用氧氣進行光呼吸作用產生二氧化碳。

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    合成生物學家設計人工代謝合成路徑的工具|Retropath 2.0

    by Eric Juo 2023 年 12 月 16 日
    2023 年 12 月 16 日

    還記得大學的生化課本介紹,所謂酵素就是降低反應活化能的分子,能夠讓原本正常條件下無法自然發生的反應,在細胞內自發或者耗能進行。酵素在細胞內就像工廠裡面的工人,各司其職負責細胞需要的產物生成或降解,而且不同類型的細胞就有不同的流水線配置,例如植物細胞可以透過一連串酵素的流水線配製,將二氧化碳固定轉化為葡萄糖或澱粉儲存;動物細胞可以利用葡萄糖為原料透過一系列酵素合成胺基酸。在合成生物學家眼中,如果將這些各有特長的酵素重組,就有可能生成任何想要的產物,或者用來分解特定的物質轉化為無害的分子。

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    只加入剛好材料的TX-TL系統 | One Pot PURE Cell-Free System

    by Eric Juo 2023 年 12 月 9 日
    2023 年 12 月 9 日

    無細胞蛋白質合成系統(Cell-Free Protein Synthesis System),又被稱為轉錄-轉譯系統(TX-TL System),最早是利用細胞裂解液為基底,再加入DNA模板、能量系統、tRNA、胺基酸及鹽類,在試管內完成轉錄及轉譯反應合成蛋白,這種方式只要先把細胞放大後,提前製備成為細胞裂解液保存於冰箱,就可以隨時拿出來合成蛋白。缺點是每批次的細胞裂解液成分略有不同,導致蛋白質合成效率不一致,而且細胞裂解液屬於複雜的混合物,難以對成分進行調整優化。因此科學家提出了以明確成分進行 …

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    生產蛋白質居然只要1天不到!? | 無細胞蛋白質合成技術

    by Eric Juo 2023 年 12 月 2 日
    2023 年 12 月 2 日

    過去生技產業生產蛋白質的方式是提供外源性DNA模板到細菌或是哺乳類細胞中,借用細胞內的蛋白質合成系統來生產蛋白。不過細胞也不是笨蛋,不會一股腦地為別人生產蛋白,細胞還是得製造自己生存需要的蛋白,因此很難再提高蛋白質生產的上限。除此之外,細胞對於生產的蛋白也有偏好,具有細胞毒殺性的蛋白產量就會非常的低。 要不我們不要細胞了?

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化工系博士班學生

一位工作多年回歸學術生活的博士班學生,以生物學背景探索化工領域,目前的研究興趣是無細胞蛋白質合成系統與酵素代謝工程。

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